Gli Scalabriniani hanno una lunga storia nel fornire assistenza sanitaria a prezzi accessibili a comunità svantaggiate. La maggior parte dei Centri Scalabriniani offre alle persone in movimento accesso a psicologi qualificati, cure mediche di base o referenze esterne. In Mozambico, ad esempio, il SIMN finanzia un programma di nutrizione per giovani madri e bambini nel campo profughi di Maratane. Gli Scalabriniani gestiscono anche ospedali e cliniche mediche in Florida e ad Haiti. L’attenzione del SIMN sulla salute mentale è particolarmente importante per i migranti, che spesso subiscono traumi significativi, ma non possono permettersi delle consulenze.